《日瓦戈医生》的成功在于故事的内在含义，影片通过主人公日瓦戈与拉拉、冬妮亚等人的人生遭遇与生活状态反映了动荡时期下的俄国人的生活状态。 下面是电影菊次郎的夏天中的感恩与供养。

运用诗意的叙事技巧在故事中完美地体现了历史对个人命运的意义，深刻地表达出人道主义的主题思想。

故事的开始是一场葬礼，小日瓦戈站在瑟瑟寒风中看着父母的棺椁缓缓下葬。父母留给他最重要的遗产是一把母亲用过的三角琴。随后他被寄养在莫斯科格罗梅教授家，教授待他视如己出，日瓦戈与教授女儿冬妮亚青梅竹马一同长大，成人后的日瓦戈成为一名优秀的外科医生，并与冬妮亚结为夫妻。

拉拉是一位漂亮的俄罗斯姑娘，她的男朋友是布尔什维克的激进分子帕夏，然而母亲的情人科马洛夫斯基却不断地引诱她，最终将其奸污。拉拉在圣诞节拿着帕夏让她代为保管的手枪打伤了正在寻欢作乐的科马洛夫斯基，日瓦戈在舞会上目睹了整个过程，并因此对拉拉产生了好感。拉拉被赶来的帕夏救出，帕夏得知了全部真相，两人迅速结婚并离开了莫斯科，拉拉与帕夏生下一个女儿。

第一次世界大战爆发，日瓦戈应征入伍，在前线野战医院工作，再一次邂逅了正在寻找丈夫的拉拉，此时的拉拉已经是一名护士。日瓦戈与拉拉在野战医院共同工作了一段时间，彼此爱慕，互相吸引，但并未做出进一步的发展。随后十月革命胜利，两人回到了各自的生活里。日瓦戈回到莫斯科与妻子、儿子、岳父生活在一起。十月革命刚刚胜利时，日瓦戈满心欢喜，赞叹苏维埃政权的诞生是“高超的外科手术”，为人民争取到了新生活。然而事与愿违，回到莫斯科后，日瓦戈一家生活愈加艰难，冬天甚至没有足够的柴取暖。就在日瓦戈偷偷取木材时，被同父异母的弟弟叶夫格拉夫・日瓦戈跟踪，在日瓦戈被发现后，叶夫格拉夫替他解围，并与其相认。在弟弟的建议与帮助下，日瓦戈一家乘坐火车前往妻子冬妮亚的外祖父家――瓦雷金诺村暂避。在停车休息的途中，日瓦戈走到另一列车时，被误以为是探子而被带上山，那里的指挥官竟然是拉拉的丈夫帕夏，他在说明自己认识拉拉后被释放，而其他一同被捕的人一律遭到枪毙。

在瓦雷金诺村的日子虽然困窘，但也平静而温馨。唯独日瓦戈的内心是焦躁的，他既不能行医，也不能继续写诗。在冬妮亚的建议下，他去尤里亚金市的图书馆看书，在那里他再一次与拉拉相遇，两人感情迅速升温。拉拉是随丈夫来到尤里亚金的，帕夏现在已经改名为斯特列里尼科夫，目前是红军的高级指挥官，他躲避拉拉，不与她见面。日瓦戈告诉拉拉，帕夏是旧军官出身，不会得到现政府的信任。日瓦戈再一次从拉拉家出来回家时，在路上被游击队劫持，被迫成为游击队的医疗工作者。一年多后，日瓦戈冒死逃出游击队，重新回到拉拉的家，看着镜子里满脸胡茬的自己难以置信。拉拉给他留了信和食物，让他等她回来。拉拉回到家见到久违的日瓦戈，两人紧紧拥抱在一起。随后拉拉给了他一封冬妮亚的信，原来冬妮亚带着父亲和儿子已经搬到国外。随着红军的胜利，拉拉的丈夫成为镇压的对象，而他早已逃跑。拉拉和她女儿的处境是非常危险的，日瓦戈带着拉拉和孩子逃到瓦雷金诺村隐居，在那里他们相依为命，度过了彼此生命中最美好的一段时光，日瓦戈将对拉拉的爱慕写成一首首热烈而真挚的诗。