因大公司的岗位内控管理较严格，现以小公司为例，来分析人员较少的情况下怎样把不能相容的印章分开管理。设想一下，如若是小公司，那么按照以上规定，公章、财务章、法人章、合同章、发票章均在财务部，如果任意大股东要求财务部员工加盖，会产生什么样的效果，抑或是财务部员工内部勾结又会有什么后果。因此，小公司应该灵活处理，把不能相容的印章分开管理，需要注意的如下：
1.票据的开具
开具票据需要财务章、法人章以及票据。因此，财务章应交于管理法人章外另一关键管理人员持有，票据第三人管理。
2.合同效力
合同力需要合同章与法人章。因此合同章交于管理法人章外另一关键管理人员持有。
3.公章的效力： 是否应该与法人章持有人分开管理?在公章代替合同章时，应该分开管理，合同法规定，公章与合同章有同等法律效力。如一个公司即有合同章又有公章时，盖具了公章的合同是否生效?为防范法人滥用权利，应该分开管理，并且在合同条款中严格规定合同的效力在加盖了合同章或公章及法人章后生效，这样即有法人及合同章或公章持有者双重确认后加盖。因此，公章除外部事务处理外也具有合同效力行为，因此，应视同合同专用章管理。
4.失职责任
公司重要的事务无非是人，财，物。在印章的使用时，应慎重考虑是否加盖印章，是否导致公司的人财物流失。其中更重要的环节是企业管理的流程，例如合同的审批流程，票据的使用流程等，严格公司的管理流程，加盖印鉴的流程，减少公司的权益损失。