含氟凝胶是一种由来已久的局部用氟方法。主要使用酸性磷酸氟(APF)，即含有氟化钠与磷酸。氟凝胶的优点是用口腔托盘放置适量凝胶一次可用于处理全口牙，比传统的涂氟方法容易，花费时间少。
含氟凝胶有二种不同类型的含氟浓度，提供给不用的使用者。供专业人员使用的有APF凝胶，浓度为1.23%，含氟离子浓度为12300mg/kg，pH为3～4.氟以HF形式存在，氟浓度很高，因此临床应用时要严格操作，尽量减少氟的摄入。APF凝胶每年应用l次或2次，平均可降低龋21.9%，每年应用2次，可降低龋26.3%.
供个人自我保健用的另一类氟凝胶有0.5%(5000mgF-/kg)的APF凝胶和NaF凝胶，还有0.1%(1000mgF-/kg)的SnF2凝胶，含氟浓度低于专业人员所用的产品，可以放置于托盘内用，也可直接用于刷牙。
凝胶的具体操作方法为清洁牙面，隔湿，吹干，用托盘装入氟凝胶放入上下牙列，嘱其轻咬，使凝胶布满牙可与牙间隙，在口内保留4分钟后取出，拭去残留凝胶，半小时不漱口不进食。专业人员与个人所用的氟凝胶项目，因为价格较贵，操作较难，较少用作为公共卫生措施。自我用氟凝胶主要用于高度易感龋病的病人，正畸治疗的病人，以及与头颈部放射治疗有关的口干综合征的猖獗龋病人。
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