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初步推断化合物类型：熔点、沸点、比旋度、折光率和比重等。
2.测定分子量、确定分子式、计算不饱和度、质谱法、高分辨质谱法。
3.结构骨架、结构片段、官能团的确定：通过化学分析方法、测定并解析化合物的有关波谱等，可确定分子的基本骨架以及含有的官能团。
如黄酮类显色反应，皂苷的显色反应等。
4.确定分子的平面结构
综合理化分析和各种波谱数据解析结果，推定化合物的分子平面结构。
5.确定化合物的立体结构
圆二色谱、旋光谱、NOE谱、2D-NMR谱，或进行X线晶体衍射或进行人工合成推断并确定化合物的立体结构。