闭经根据病因及病理生理，应用相应激素补充其不足或拮抗其过多，达到治疗目的。
(1)性激素替代治疗：对先天性卵巢发育不全、卵巢早衰患者可用性激素替代治疗，应用性激素后出现周期性撤退性出血，类似月经来潮，一方面可改善患者的生理和心理状态;另一方面可维持和促进生殖器官和第二性征一定程度的发育。长期应用激素替代治疗，还可预防骨质疏松，减轻和消除雌激素缺乏引起的症状。根据情况选用雌、孕激素序贯疗法、雌激素替代疗法(无子宫患者)或单用孕激素。
(2)诱发排卵：适用于有生育要求者。常用枸橼酸氯米芬(CC)、促性腺激素或促性腺激素释放激素(GnRH)治疗。
(3)溴隐亭：适于高催乳激素血症者。
(4)其他激素治疗：肾上腺皮质激素适用于先天性肾上腺皮质增生症导致的闭经。甲状腺素适用于甲状腺功能减退导致的闭经。