由于受郡守节制，县令长不仅要遵循郡守的安排，听从郡守的命令，而且在心理状态上他们更是处于极端的弱势。文献上记载郡尉惧郡守时皆用县令长见郡守以为比喻，如：像郅都为守时，“始前数都尉步入府，因吏谒守如县令，其畏都如此”。周阳由“为守，视都尉如令”。这从一个侧面反映了县令长惧郡守之甚。他们在与郡守的关系中基本处于从属地位。此外，郡守可檄告属县，对其发布命令，责令听从。例如，朱博告县的檄文日：“府告姑幕令丞言贼发不得，有书。檄到，令丞就职，游徼王卿力有余，如律令!”特别在行县或接受上计时郡守可行黜陟之权，对课殿或排名在后的县令长进行责问如《汉书·贡禹传》的记载中有：贡禹“岁余，以职事为府官所责，免冠谢”。丞掾对韩延寿所言：“宜循行郡中，览观民俗，考长吏治迹。”

而在县令长对郡守表示不恭时，郡守就会对县令长进行责罚。《汉书》载：“(翟)义行太守事，行县至宛，丞相史在传舍。立持酒肴谒丞相史，对饮未讫，会义亦往，外吏白都尉方至，立语言自若。须臾义至，内谒径入，立乃走下。义既还，大怒，阳以他事召立至，以主守盗十金，贼杀不辜，部掾夏恢等收缚立，传送邓狱。”对贪猾之县令长，郡守既可以劝其自己去官，也可以传檄令其去职，而为置守令。如薛宣温言使贪猾的高阳令杨湛解印，移书使非法不逊的栎阳令谢游去官，并调守令。

郡守为县置守令乃较平常之事。遇到能吏，郡守就可便宜行事，使转守他县。这种人可以是在任的县令长，也可以是其他吏员，只要治县有效就行甚至已有在任县令长的县，也可同时置守令，二人同时治事。有能的县令还可兼行一至几县之事。如王尊“初元中，举直言，迁虢令，转守槐里，兼行美阳令事”。尚方禁“禁晨夜发起部中盗贼及它伏奸，有功效。博擢禁连守县令”。刘平“王莽时为郡吏守茁丘长，政教大行。其后每属县有剧贼，辄令平守之，所至皆理，由是一郡称其能”。上述三例说明郡守为县置守令、守长，或使兼摄多个县并非个别情况。另文献记载中还有魏相、尹赏守长安令，王莽时尹公守茂陵令。但其皆为朝廷选守，非郡守所选郡守还可以向上报送有功的官吏以调补县令长。例如，张敞为胶东相时，就“吏追捕有功，上名尚书调补县令者数十人”。

(二)在与所治民众的关系中，县令长又处于绝对权威的地位。县令长在服从郡守的同时，在本县具有极大的权威。特别是有些郡守为了让令长保持在县里的权威，“不欲代县治”。这使得县令长在治县时能充分运用其专治权力。

焦延寿为小黄令时，“以候司先知奸邪，盗贼不得发。爱养吏民，化行县中”，在吏民中有相当高的威信，受到广泛爱戴。王尊在处理“美阳女子告假子不孝”的案件中，“取不孝子县(悬)磔著树，使骑吏五人张弓射杀之，吏民惊骇”。尹赏治长安，“修治长安狱，穿地方深各数丈，致令辟为郭，以大石覆其口，名为‘虎穴’。乃部户曹掾史，与乡吏、亭长、里正、父老、伍人，杂举长安中轻薄少年恶子，无市籍商贩作务，而鲜衣凶服被铠姨持刀兵者，悉籍记之，得数百人。赏一朝会长安吏，车数百两，分行收捕，皆劾以为通行饮食群盗。赏亲阅，见十置一，其余尽以次内虎穴中，百人为辈，覆以大石。数日壹发视，皆相枕藉死，便舆出，瘗寺门桓东，蟹着其姓名，百日后，乃令死者家各自发取其尸”，“赏视事数月，盗贼止，郡国亡命散走，各归其处，不敢窥长安”。这些都充分体现了县令长的专制威权。

(三)县令长与当地王侯存在若即若离的君臣关系。由于西汉初期郡国并行制的遗存，地方二千石，特别是王国相有监视、制衡诸侯王的职责，而对于后来分封的侯，中央也同样为其置相，以治民与监视为数众多的侯。西汉后期分封的侯国相对较小，因此，大部分的侯国相都是四百石、三百石的秩禄。他们是中央任命的官吏，除治民外，有替中央监视侯王动向的义务，因此，侯国相除了具有一般县令长的特征以外(侯相同样属郡守管辖，是县令长级的治民官)，还有其本身的特点。