工作坊的建设还在起步阶段，还存在许多不足之处。
(一)工作坊的指导老师由专业教师兼职，教师指导学生同时还要担任教学任务，由于指导教师的精力有限因此指导教师不能将全部经历花费在工作坊的指导工作中，虽然工作坊配备了企业技术兼职人员，企业技术员由于工作原因也不能随时指导学生，因此学生在遇到自己无法解决的问题需要指导老师的帮助时不能第一时间得到帮助，影响工作坊项目的进度。因此工作坊还需配备专职的指导教师。
(二)由于大部分专业教师缺乏实践经验，对遇到的许多实践操作方面的难题有时也无法解决，从而影响工作坊的成绩的提高。因此教师还需要经常到企业实践，以提高自身的实践能力。
(三)学生在开展工作坊项目时，学生参差不齐，能力强的学生能够按照指导老师的要求完成各项任务，有些同学能力相对较弱，虽然参与的积极性很高，但在遇到自己不能解决的问题时，依赖老师、其他同学的依赖性很强，因此工作坊的开展还应考虑针对不同层次的学生在分配任务方面应依据不同学生的特点，针对其长处分配不同任务，充分调动学生的积极性，使学生的特长能够得到充分发挥。
(四)有些学生做事虎头蛇尾，在工作坊的前期工作开展中积极性很高，但是在后期项目的开展中，没有持之以恒的缺点渐渐暴漏出来，不能很好的完成组长分配给自己的任务。因此如何培养学生的耐性，培养学生科学严谨的态度，是工作坊在今后的建设中一项重要任务。
四、总结
工作坊教学模式的引入对学生的自主学习能力、自主创新意识及创新能力、团队协作意识等方面得到了显著的提高，也调到了学生的学习积极性。同时也提高了教师的科研能力与实践操作水平。虽然工作坊模式还在起步阶段，还存在许多不足之处，工作坊的建设通过指导教师和参与的同学不断的摸索，改进了许多不足之处，取得了很大进步，因此工作坊教学模式是提高学生自主学习能力的一个很好教学模式，值得推广下去。