(二)财务专业技术人才的问题

网络财务是电子网络与财务管理互相结合的产物，而网络技术与财务管理是两个不同的科学分支，其不仅要求从业人员精通计算机网络技术，还要其具备相当的财务管理知识与娴熟的财务业务技能。此外，财务人员要保证相关财务信息的准确性与可靠性，比如成本信息，就要深入了解产品的生产过程与生产工艺，掌握一些相关的基本知识;此外，网络财务管理人员还会面临着其它的新课题，比如人力资源财务的构造、信息、知识产权等无形资产的计价，因此网络财务人员要具备较高的综合素质，不仅要有广博的知识，还要具备较强的创新能力与适应能力。但是现在很多企业的网络财务管理人员不仅专业技术水平有待提升，实践操作能力较低，而且对网络技术的了解也相对较少，所以无法较好的适应网络财务的发展与进步。

(三)安全问题

网络的开放性是一把双刃剑，虽然网络财务具备通过数据化的形式运作、应用大量的电子单据等优势均要归功于网络技术开放性的特点，但是从另外一个角度来看，正是由于网络的开放性，使得财务信息所遭受到的威胁也更多。财务信息由电子符号来取代、利用网络传统财务数据、无形资产的转移等，均加大了识别安全隐患、实现内部控制的难度。数字化的原始凭证伪造更加容易，使得财务管理过程中缺乏有效的牵制，内存数据不留痕迹、系统文件不可读、指定程序进行数据处理等等，这些均会存在一些潜在的安全问题。此外，由于系统中各个职能环节的分工界线相对模糊，总账与明细账之间不再存在制约关系，一旦系统运行出现差错，则会引发一些连锁性、重复性的错误。

(四)网络财务数据接口的标准化问题

网络财务的应用与企业内部各个管理系统之间存在多方联系，而网络财务与其经外部社会部门，比如银行、税务、保险以及海关等也会发生数据交流，因此网络财务系统的数据接口就面临着标准化的问题。现阶段我国市场上通用相关网络财务软件有多种，但是缺乏一个标准的、统一的数据输入与输出接口，所以软件之间无法实现自由的数据交换，从而对网络财务系统软件的应用、网络财务功能的发挥均会产生不利影响。