（二）征税范围过窄
在资源税方面，许多国家都将水、森林、草原等生态资源列入征税范围，而我国目前只对矿产品和盐征税，相比之下覆盖面太小。在消费税方面，我国虽然在2006年4月对税目进行了大规模调整，加入了石油制品、木制一次性筷子和实木地板等项目，但总体来讲课税范围依然不宽，一些容易给环境带来污染的消费品并没有列入征税范围，如电池、化肥、含磷洗衣粉和塑料制品等，这对环境保护来说是很不利的。在资源税方面，现行资源税暂行条例规定仅对原油、天然气、煤炭、其他非金属矿原矿、黑色金属矿原矿、有色金属矿原矿、盐等七大类资源征税，征税范围太窄，反而刺激部分企业对非税资源的掠夺性开采和使用。
（三）现行税收政策存在“重鼓励、轻制约”的缺陷
目前，国家在再生资源回收、资源综合利用、节能减排等方面出台了许多优惠政策，但对资源浪费、环境污染等方面的制约性税收政策明显不足，主要体现在以下几个方面：一是资源税制度存在缺陷。资源税除石油和天然气以外以销售量或自用量为计税依据，导致企业在开采中“拣肥弃瘦”，造成资源无序开采和大量浪费；大多数资源产品采用定额税率，导致应纳税额与资源的价格相脱离，税收杠杆和价格杠杆均无法发挥调节作用。二是消费税制有待于进一步完善。如对造成资源严重浪费和污染的一次性用品，除了方便筷之外，卫生纸品、塑料包装袋、电池等均还没有纳入征税范围。三是缺乏完善的环境保护税制。
（四）“两型”社会改革试验区建设缺乏专项的税收政策支持
在“两型”社会建设上，目前国家还没有出台专门针对资源节约和环境保护方面的区域税收优惠政策，也缺乏扩大资源税征收范围、开征环境保护税等等政策研究和试点等政策支持，在一定程度上制约了“两型”社会的建设进展。