1、海关发票格式不一，不同国家或地区有其本国或本地区规定的专门格式，来证内一般有规定，切勿用错格式。
2、凡是商业发票上和海关发票上共有的项目和内容，必须与商业发票保持一致，不得相互矛盾。
3、关于海关发票价格构成的填写，海关发票一般均要求列明构成该价格的各项费用，若按CIF价格条件成交，则应分别列明运费，保险费和FOB价格，这三者的总和应与CIF货值相等。此外，尚应列明包装费，打包费，货物运至装运港码头的搬运费等费用。“出口国当地市场价格”以本国人民币表示。但该栏价值应比FOB价格低4—5%左右，否则会被认为是低价倾销。
4、有些国家的格式有“费用栏”，填写时应尽量填全。如果有“是否包括在国内市场价内”的要求，也应给予表明。如果填“不包括”或“包括”都直接影响“国内市场价”的计算额，应注意计算的正确。
5、关于海关发票的签署，要求以个人名义用手签方式签署的海关发票，则不盖公章;如需要监签人(证明人)，也要手签。海关发票的签字人或其它单据的签字人不得作为监签人。海关发票如有涂改，须由原缮制人用钢笔小签，不能加盖校对印章，也不得由监签人代行。
6、海关发票的“原产地”一项应填“中国”字样，切勿漏掉。
7、海关发票是用外文印制的，填写时一般要用相应的外文进行，要求文字简。
8、西非海关发票中，有以个人名义签字的，要求填写见证人，签字则该“见证人”不能出现在其它出口单据上，即签字人与见证人是2个独立的身份出现方有效。